表观修饰质谱服务，N多选择！核酸、蛋白质、组蛋白、糖RNA等修饰质谱
核酸修饰质谱主要通过多重PCR、高通量芯片以及高分辨率质谱来实现核酸检测，是继PCR、高通量测序技术之后新型的分子诊断技术，能够将两者技术优势相结合，具有通量大、灵敏度高、检测精度高、检测速度快、成本低等优点[1]。表观生物利用Bruker timsTOF Pro2捕集离子淌度飞行时间质谱仪、SCIEX zenoTOF 7600、SCIEX 6500+质谱平台系统，结合对核酸修饰分析领域的领先技术优势，推出针对包括多种RNA、DNA特别是糖 RNA 的核酸修饰质谱分析服务，精确检测多种核酸修饰类型在样本中的修饰丰度。
一、核酸修饰质谱
1、多种 RNA 修饰质谱分析
RNA上的化学修饰对于RNA的结构和功能起到了重要的调控作用，阐明RNA修饰的生物学意义需要能特异性检测、量化修饰核苷进行高灵敏度分析的工具。
表观生物RNA修饰质谱分析，对mRNA、tRNA 和 total RNA样本分别可精确检测18 种、37 种、26 种RNA修饰类型。
mRNA 可检测修饰列表
样品需求量：0.5~1 µg
可分析样品：mRNA、tRNA 和 total RNA
样品处理时间：质谱前处理时间约1天，具体根据RNA类型而定
质谱分析时间：每个样品15 min
服务周期：一周到两周（具体根据 RNA 类型以及样品数量而定）
分析方法：靶向分析或非靶向分析
预期结果：mRNA经ploy(A)富集后并使用rRNA去除技术后可达18种高保真度mRNA修饰；tRNA根据富集方法可检测37种修饰；total RNA可检测26种修饰（大多数来源于 rRNA 及 tRNA 修饰），具体看以下列表：
tRNA 可检测修饰列表
total RNA 可检测修饰列表
2、糖 RNA 糖组质谱分析
2021年，Flynn等人首次报告称RNA可以以糖RNA（即糖基化 RNA，英文为 GlycoRNA）的形式在细胞外存在[2], 揭示了细胞表面生物学中以前未被认识的复杂层面。2024年8月，Flynn团队发现RNA与N- 聚糖化学连接的机制[3]，证明糖缀合物不仅有糖蛋白和糖脂，还有第三类：糖RNA。2024年Flynn团队也已在预印本文章中报道糖RNA存在O- 聚糖的证据[4]。糖RNA可能是免疫系统识别和响应细胞的关键组成部分；细胞表面存在糖RNA也可能对细胞间通讯和信号传导产生更广泛的影响。
表观生物推出糖RNA糖组质谱分析服务，可检测并定量高甘露糖、岩藻糖化、唾液酸化等60种以上不同的N-聚糖以及约10种core2类型O-聚糖，探索糖RNA生物学的更多秘密。
样品需求量：2~10 µg
可分析样品：小RNA组分
样品处理时间：N- 聚糖处理时间为2天，O-聚糖处理时间为3天
质谱分析时间：每个样品分析需70 min，大队列样品可选择高通量的基质辅助激光解吸电离 (MALDI) 质谱分析，每个样品分析仅需3 min
服务周期：预计2周完成整个流程（若样品数量≥ 100，周期需酌情延长）
分析方法：非靶向N-聚糖或 / 及O-聚糖分析
预期结果：可检测并定量高甘露糖、岩藻糖化、唾液酸化等60种以上不同的N 聚糖以及约10种core2类型O-聚糖
3、糖 RNA 修饰质谱分析
糖基化 (Glycosylation) 是生物分子最普遍、最重要的修饰之一，这些修饰在细胞识别、信号传导、蛋白质折叠和稳定性以及免疫反应等生物过程中发挥关键作用。2024年8月，Flynn团队发现修饰的RNA碱基 acp3U是糖RNA中N-聚糖的结合位点[3]。此后，越来越多研究开始关注 RNA糖基化的标记、监测及生物功能。然而，由于糖RNA分子含量极低（预计在总体RNA分子中的含量低于0.001%），依赖传统手段获取这一关键信息极其困难。
表观生物推出基于最新rPAL标记技术的糖RNA修饰质谱分析服务，通过生物素-亲和素系统和强洗涤条件对糖RNA进行高效富集，并进行 RNA修饰质谱分析，以极高的灵敏度和特异性识别糖RNA分子中的糖基化位点，突破了传统RNA分析的限制，为研究RNA修饰和糖基化的关系、RNA与糖链之间的复杂相互作用提供了强有力的工具。
样品需求量：具体请详询
可分析样品：富集后的糖RNA组分
样品处理时间：质谱前处理时间约1天
质谱分析时间：每个样品20 min
服务周期：预计3~4天完成整个流程（若样品数量≥ 100，周期需酌情延长）
分析方法：非靶向分析
预期结果：acp3U、galQ、manQ 等糖RNA链接修饰及其他可能存在的共存修饰
4、DNA 修饰质谱分析
DNA分子上的5mC和5hmC是哺乳动物基因组中两种最重要的表观遗传修饰，在调控基因表达及细胞功能方面扮演着不可或缺的角色，它们在DNA分子上的分布和动态变化对于理解基因表达和细胞命运的决定具有重要意义。然而，传统的DNA甲基组测序方法无法区分这两种修饰，限制了对两者在基因组中分布和动态关联的研究。
表观生物DNA修饰质谱分析可检测5mC和5hmc两种DNA甲基化修饰，助力研究者进一步揭示它们在疾病发生发展过程中的作用。
样品需求量：0.5~1 µg
可分析样品：DNA
样品处理时间：质谱前处理时间约1天
质谱分析时间：每个样品15 min
服务周期：1周（若样品数量≥ 100，周期需酌情延长）
分析方法：非靶向N-聚糖或 / 及O-聚糖分析（可选 LC 或 MALDI 分析）
预期结果：通常检测5mC和5hmC，潜在检测5fC
二、蛋白质修饰质谱
人类蛋白质组包含的许多的功能性多肽，跟翻译的同时和翻译后的蛋白修饰密切相关，所以识别翻译后修饰的蛋白质及其修饰位点，是蛋白质组学研究的重要领域之一。蛋白质修饰的常见类型包括糖基化、磷酸化、甲基化、乙酰化和泛素化等。质谱是对血液、细胞、组织等生物样本进行以上多种蛋白质翻译后修饰定量分析的重要手段。
表观生物蛋白质修饰质谱分析服务，基于timsTOF Pro2捕集离子淌度飞行时间质谱仪和SCIEX zenoTOF 7600飞行时间质谱仪等业内一流分析测试设备，结合在蛋白质组分析领域的领先技术优势，重点发展微量、痕量、低丰度蛋白样本的深度鉴定技术与面向临床的蛋白质糖基化深度精准分析技术，可实现低丰度蛋白质和蛋白质翻译后修饰（糖基化、磷酸化等）的高覆盖、高通量、高灵敏度定性和定量分析。
样本需求量与可分析样本：
1. 细胞，≥ 1×107 个细胞/样本
2. 蛋白质，≥ 1mg/样本
3. 血清、尿液、脑脊液等体液样本，具体请详询
服务周期：预计2周完成整个流程
分析方法：4D糖蛋白组或EAD糖蛋白组（更高置信度的位点鉴定）
预期结果：原位解析糖型、糖基化位点、糖基化肽段和相应蛋白
可检测修饰类型与应用
三、组蛋白修饰质谱
组蛋白修饰（Histone Post-Translational Modification）是最为重要且多样的表观调控方式，因此组蛋白及相关修饰一直受到广大研究者关注。组蛋白修饰传统方法ChIP-seq一次只能对一个位点的一种修饰进行检测，而表观生物组蛋白修饰质谱分析可检测并定量150种以上不同的组蛋白修饰肽段，为研究组蛋白修饰在生理和病理发生发展过程中的作用提供全新的研究方案。
样品需求量：1~10 µg
可分析样品：细胞或组织组蛋白提取物
样品处理时间：组蛋白提取需2 天，质谱前处理时间1 天
质谱分析时间：每个样品20 min
服务周期：预计1周完成整个流程（超过100个样品，周期需延长）
分析方法：非数据依赖型组蛋白定量分析
预期结果：可检测并定量 150 种以上不同的组蛋白修饰肽段
可检测组蛋白修饰肽段
可检测组蛋白修饰位点