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终于来了!细数2018NSFC中的表观遗传热点!
发布时间:2018-08-24 19:12:56 | 浏览次数:

       

8月16日,翘首以盼的国家自然科学基金项目终于公布了。在医学与生物学相关研究邻域中,表观遗传学现有的研究成果,是咱们华人科学家贡献比较多的一个领域。而从2018年国家自然科学基金中,我们也看到了许多令人兴奋的表观遗传研究项目。今天,Epi老师来跟大家盘点一下。


超级增强子

“增强子”相关的2018NSFC中标项目共27个,资助金额共1202万元。


       与普通增强子相比,超级增强子跨度范围通常可达8-20 kb,并且,超级增强子具有更强的转录激活相关组蛋白修饰、辅因子及转录因子富集密度。这些特点决定了超级增强子具有强大的调控功能,与生理病理机制息息相关。

       从上图可以看到,今年增强子项目增幅超过了42%。其中获得资助基金最多的一个项目是利用多组学数据解析增强子之间的层次结构;此外还有利用染色质3D技术研究增强子的作用机制的项目。


2018 NSFC 增强子相关项目列表


目名称

依托

经费

负责

整合染色构象和高通量实验解析肥胖基因编码易感SNP的增控机制

西安交通大学

59

杨铁

组蛋白修饰H3K4me3在增子元件上的选择标记和功能研究

中科院上海生科院

59

邵振

整合多学数据解析增子之

大学

60

黄佳良

LncRNA APTR雌激素ERα/Wnt通路增肌瘤胞增殖的机制研究

大学

57

张永

甲基化敏感的增子元件DERARE在造血控和白血病克隆演中的作用和机制研究

浙江大学

57

钱鹏

化学致癌物DNP活化超增MICAL2鼻咽癌移的分子机制研究

中南大学

57

基底型超驱动的透明酸代异常在鼻咽癌分化障碍中的作用机制

中南大学

57

李桂源

子甲基化修异常在食管展中的机制研究

中山大学

57

林德晨

EB病毒核抗原1HOXB13子形成从而促鼻咽癌增殖和移的机制研究

中山大学

57

郭翔

建立活性可控的基因编辑并靶向特异性超子的三阴性乳腺癌治疗实验研究

西安交通大学

53

13q12.12肺癌风险染色区增遗传变异的生物学效及机制

南京医科大学

57

孙玉洁

YY1转录复合体结合超级增强子调控QKI生成circRNA的分子机制研究

南开大学

58

杨诚

控的长链编码RNA在食管癌中的功能及其分子作用机制

大学

57

谢剑

激相关超肝癌胞自噬的控及其疗药物敏感性的影响

安徽医科大学

57

孙国

子源cirRNA-EYA3ceRNA调控ATM—DNA损伤通路参与肝癌对125I放射抵抗的机制研究

中山大学

57

张福

Rbpj的超子形成在NK细胞功能调控中的作用及机制研

第三医大学

57

邓有

雌激素诱导的超驱动lncRNA ERRL在乳腺癌中的功能和机制研究

中山大学

25

利用4C-seq统鉴IFITM基因的增子及表达控机制和功能研究

军科院军事医学研究院

27

李平

利用CRISPR-cas9统筛选和解析与癌症展相关的增

中科院北京基因研究所

27

李春燕

融合基因组变异和表重建泛癌关图谱及其功能分析

尔滨医科大学

27

赵红颖

运用新型高通量增告系统对多种型的全基因组调控原件的研究

浙江西湖高等研究院

27

马丽

整合基因和表基因特征的增RNA精确预测方法及功能分析

尔滨医科大学

26

驱动lncRNA HCCL5-ZEB1正反馈调节在肝胞癌中的作用 及机制研究

中山大学

21

子上的遗传变异与肝癌风险的关系及功能机制研究

南方医科大学

21

MLH1子区域SNVrs143969848CTCF影响结肠MLH1基因表达的机制研究

复旦大学

21

刘青

受超驱动转录因子MEIS1与尤文氏肉瘤特异融合蛋白EWS-FLI1互作的分子机制及功能研究

中山大学

21

调控BET家族蛋白介的基因转录对抑制绿脓菌素引起的细胞应激和炎症损伤的研

湖北民族学院

43

刘可云



在增强子的27个项目中,标题明确为超级增强子的就占了12项。超级增强子的研究创新力度大,是精准医学研究领域的一个新方向,具有成为未来国自然的资助热点的巨大潜力。



RNA甲基化

“RNA甲基化”相关的2018NSFC中标项目共65个,资助金额共2915.5万元。

RNA甲基化项目增长过半!包括m6A修饰相关的甲基转移酶 (METTL3, METTL14, WTAP等) / 去甲基化酶 (FTO, ALKBH5等) 以及一些RNA结合蛋白 (YTHDF1/2/3, ELAVL1等) 。

今年还首次出现了近300万资助金额的RNA甲基化重点项目!无独有偶,这两个重点项目研究对象都是致癌病毒:

项目名称

依托单位

经费

负责人

鼻咽癌中YTHDF1复合体降解病毒m6A修饰RNA调控EBV感染状态及肿瘤进展

中山大学

295万

曾木圣

HPV  E6/E7调控METTL3所介导的m6A-RNA在宫颈癌细胞中的作用与机制研究

天津医科大学

293万

汤华




RNA结合蛋白

“RNA结合蛋白”相关的2018NSFC中标项目共28个,资助金额共1027万元。


由于RNA结合蛋白数量众多(人类有1912个),这些研究中涉及到相同的RNA结合蛋白的项目不多,HuR、RBP4相关项目各有2个,已经算是"热门"分子了。

另外,先前研究表明,ciRNA、lncRNA等非编码RNA能够调控RNA结合蛋白,所以近几年NSFC都有出现非编码RNA与RNA结合蛋白的互作研究就不足为奇了。(了解肿瘤相关RBP请点击)


项目名称

依托单位

经费

负责人

circHMGCS1与RNA结合蛋白HuR相互作用参与恶性胶质瘤干细胞的干性维持及其机制研究

中山大学

21万

何洁华

LINC00589竞争吸附RNA结合蛋白PIWIL2和miR-100-5p并同时调控乳腺癌 HER2 靶向耐药及其诱发的肿瘤干细胞化和多药耐药研究

兰州军区乌鲁木齐总医院

21万

白文栋




非编码RNA

“非编码RNA”相关的2018NSFC中标项目超过1000个,其中涉及环状RNA的近200项,miRNA逾800项,项目有所重叠。


miRNA项目数量已进入增长平台期,而circRNA的增长速度也开始放缓。显然,如何从新的突破口研究非编码RNA,是研究者们的新课题,这从越来越多样化的项目名称中可见一斑。

除了上文提到的RNA结合蛋白研究方向,还有从RNA甲基化、蛋白甲基化修饰层面、超级增强子角度研究circRNA等非编码RNA的项目:


项目名称

依托单位

经费

负责人

HNRNPL上调circ_0001964通过RNA甲基化调控非小细胞肺癌顺铂耐药的机制研究

南京医科大学

58万

王朝霞

circRNA-015622调控DC-STAMP去甲基化促进破骨细胞前体融合在骨质疏松中的作用机制研究

第三军医大学

21万

窦策

METTL3/YTHDF2 m6A轴介导的circ-DNMT3b的竞争性表达调控及其在膀胱癌顺铂耐药中的机制研究

浙江大学

57万

刘犇

Rab26调控环状RNA-LECRR甲基化促进肺血管重构的功能及机制

第三军医大学

57万

尤再春

超级增强子调控的长链非编码RNA在食管鳞癌中的功能及其分子作用机制

汕头大学

57万

谢剑君

超级增强子源cirRNA-EYA3作为ceRNA调控ATM—DNA损伤通路参与肝癌对125I放射抵抗的机制研究

中山大学

57万

张福君



外泌体

“外泌体”相关的2018NSFC中标项目共459个,资助金额高达1.76亿!


今年获得高额资助的重大项目只有一项,而去年有两项:

项目名称

依托单位

经费

负责人

年份

外泌体miRNAs介导细胞间应答网络调控心房代谢重构在心房颤动中的作用与机制

哈尔滨医科大学

298万

李悦

2018

外泌体介导的肾癌肺转移前微环境改变调控肿瘤细胞间质上皮转化的机制研究

第二军医大学

290万

王林辉

2017

基于HIF通路与外泌体非编码RNA的砷暴露所致健康危害机制及风险评估研究

南京医科大学

290万

刘起展

2017



除了外泌体circRNA、lncRNA的研究,还有外泌体mRNA的研究项目(了解外泌体与mRNA可点击此处):


项目名称

依托单位

经费

负责人

AXL通过外泌体Linc00852-miRNA-AXLmRNA正反馈调控环路介导不同转移潜能细胞间通讯在骨肉瘤转移中的作用及机制研究

中山大学

57万

彭挺生


还有涉及RNA甲基化,蛋白甲基化的外泌体项目:


项目名称

依托单位

经费

负责人

Smad6精氨酸甲基化调控LIPUS诱导的PDLSCs外泌体对牙周再生作用机制研究

重庆医科大学

21万

张莛蔚

RNA甲基化修饰在心脏祖细胞来源外泌体治疗心肌梗死中的作用及机制研究

东南大学

56万

马根山

外泌体作用机制的研究是越来越深入了。


讨论

表观遗传学核心的研究方向如RNA甲基化、RNA结合蛋白以及超级增强子,在国自然科学基金中仍是一个新兴的研究对象,相关项目数量稳步上涨但尚未爆发,如同10年前的miRNA,5年前的外泌体和2年前的circRNA。而非编码RNA与外泌体的研究,则越来越多样化,比如与RNA甲基化、RBP以及超级增强子结合。多热点组合研究将这些领域的发展推向一个新的高度。这些崭新的研究项目,其未来的结果令人期待!




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