新春伊始

表观生物隆重推出

超级转录组测序服务：

SLAM-seq结合IPA网络分析

强强联手

SLAM-seq对差异表达的RNA检测更灵敏

IPA分析可视化关注的基因-通路-疾病网络

绘制相互作用网络图

原价¥45,000/项目

促销价¥24,990/项目！

产品形式：SLAM-seq + IPA分析

促销定价：¥24,990/项目

样本要求：人、大小鼠细胞，≥1x10⁶个细胞/样本

分组建议：3 V 3

测序数据量：8G/样本 （主要分析mRNA）

分析条目：SLAM-seq分析和IPA分析

 

SLAM-seq分析内容

1. 序列比对

2. 文库质控

3. Mapped Reads过滤

4. 背景T>C SNP校正

5. mRNA差异表达分析

6. 靶基因GO富集分析

7. 靶基因KEGG富集分析

8. mRNA转录本水平T>C counts计数与表达量化

9. mRNA转录本水平Total reads计数与表达量化

10. 新mRNA及总mRNA差异分析

11. 新mRNA及总mRNA GO/KEGG分析

 

IPA分析内容

1. 非定向相互作用网络分析

2. 预测上游调控

3. 预测下游效应

4. 预测调控效应

5. 匹配分析

6. 特定基因-通路-疾病互作网络构建及可视化

 

  IPA核心分析内容示例  

可选根据客户关注的或从核心分析中选出的基因、通路、疾病等进行单独的可视化，绘制特定基因分子间-通路-疾病作用网络图。

1. 非定向相互作用网络分析(Networks)

显示在QIAGEN知识库中，以焦点分子为中心的分子间相互作用网络图

2. 预测上游调控(Upstream Analysis)

预测可能导致在数据集中观察到的基因表达变化的上游调控因子

3. 预测下游效应(Downstream Effects)

探索根据数据集中差异表达基因的模式预测下游表型、功能或疾病Diseases & Functions

4. 预测调控效应（Regulator Effects）

根据数据库预测激活或抑制的上游调节器在数据集中如何调节表型、功能或疾病

5. 匹配分析(Analysis Match)

可以与已有文章数据或者不同的差异分组进行比较多组学、多时间、多剂量差异比较组分析

6. 特定基因-通路-疾病互作网络构建及可视化

根据客户关注的或从核心分析中选出的基因、通路、疾病等进行单独的可视化，绘制特定基因分子间-通路-疾病作用网络图。