small RNA测序服务
项目简介
small RNA测序服务
miRNA
miRNA是真核生物中广泛存在的一种长约21到23个nt的(RNA)分子,属于一种重要的非编码RNA,可调节其他基因的表达。成熟的miRNA非常稳定,不容易降解,进入血液后能长期滞留,发挥调控作用。miRNA通过靶向其靶基因mRNA,抑制mRNA,从而影响其靶基因表达,在细胞周期、肿瘤发生、干细胞分化等生物学过程中起重要作用。
piRNA
piRNA(Piwi-interacting RNA)是一类能够和 Piwi 蛋白结合并发挥功能的小非编码 RNA,其长度约为 24-33bp。在基因组内,piRNA 主要成簇分布,形成 piRNA cluster,在生殖细胞中,piRNA 的首位碱基往往具有很强的 U 偏好性。研究发现 piRNA 具有类似 miRNA 的调控机制,能够靶向 mRNA 的 3’UTR 并降解 mRNA,另外他们也能参与到转录水平的调控中,影响基因的表达。
tsRNA
tsRNA 是 tRNA 来源的小非编码 RNA,他们中的部分形成于 tRNA 的成熟过程,而其余部分则在 tRNA 形成成熟的二级结构之后,经特殊的酶进行酶切后而产生。研究表明,tsRNA 在表观遗传调控方面扮演着重要的角色。
表观生物利用最新的高通量测序技术和生物信息分析方案(样本≥10个,即送miRNA调控网络分析),为您提供最为全面的外泌体miRNA测序服务!
技术优势
1. 革新的QIAseq数字NGS建库技术,完美实现少量样本准确定量
2. 生物信息分析内容丰富,包含miRNA调控网络分析,无需额外费用!
测序方案
测序模式:SE 50
测序数据量:10M reads
测序平台:Illumina 3000/4000
送样要求
4 ug
总RNA
1x10⁶个
细胞数量
2 mg
组织
分析内容
基础分析
1.原始数据过滤、质控
2.基因组、miRbase22、Rfam比对
3.miRNA分析
4.piRNA分析
5.tsRNA分析
6.small RNA差异表达分析
高级分析
1.small RNA靶基因分析
2.small RNA靶基因G0分析
3.small RNA靶基因KEGG分析
4.small RNA-mRNA调控网络图
图1. small RNA显著差异热图
表观生物实测数据
图2. 不同软件分析small RNA靶基因的交集维恩图
图3. 靶基因KEGG分析
图4. 靶基因GO分析
图5. 靶基因GO分析气泡图
图6. 靶基因KEGG分析气泡图