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等了四年,miRBase 22 终于来了!
发布时间:2018-03-19 13:48:25 | 浏览次数:

经过漫长的等待,3月13日,我们终于迎来miRBase 22的官方发布了!上一次miRBase 21的发布已经是2014年的事了。经过近四年的寂静,miRBase 22给等待它的人带来了什么惊喜呢?快来了解一下!


miRBase序列数据库 (www.mirbase.org),为研究者免费提供miRNA序列注释、预测基因靶标等信息,是关于miRNA全方位数据的一个重要的公共数据库。库中所有数据都可以从首页downloas page或直接进入FTP站点下载。




So, what is new in miRBase 22 ?


序列数目增加了三分之一!


正如研究者所期盼的,这次miRBase 22所收录的miRNA序列数量大增——超过了原本的三分之一!增加的这部分主要来自于之前数据库中没有的物种的新miRNA注释。具体地说,这次发布的版本新收录的物种达到了48个。尽管如此,miRBase发言人Sam认为他们仍然疏漏了部分已发表的miRNA注释,并表明会更加努力查缺补漏,更勤快地更新数据库。



深度测序数据集的收录和管理方法优化


在这次的新版本中,深度测序数据集的数目跃升为831个。miRBase现在拥有约1,000多个数据集,之前遇到的数据库技术问题以及网页的速度问题,都已经得到修复,使浏览数据时体验变得更好。更新后,希望数据库中越来越多的miRNA可被归类为“高可信度” (high condifence) 。



可跟踪查看miRNA序列的新变化


miRBase 22使用了新研发的接口,可一直保持跟踪miRBase的变化更新,点击"change log"链接即可进入查看。


除了上述的更新亮点,miRBase还即将推出收集序列信息的网页程序化服务。



相信miRBase 22的发布,能够给miRNA研究者带来更多的帮助和便利。表观生物为客户提供外泌体small RNA测序服务(点击此处了解详情),分析数据库已升级至miRBase 22版本,欢迎咨询!电话400-775-0875,QQ: 746199904。



 
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