项目简介：

       RNA 甲基化指发生在RNA 分子上不同位置的甲基化修饰现象，常见的RNA转录后修饰方式有6-甲基腺嘌呤(N⁶-methyladenosine，m⁶A) 和5-甲基胞嘧啶(C⁵-methylcytidine，m⁵C)等。     

       最新研究发现，m⁶A修饰在调控基因表达、剪接、RNA 编辑、RNA 稳定性、控制mRNA寿命和降解、影响蛋白翻译等方面扮演重要角色。因此meRIP-seq助力解决细胞分化，生物发育、疾病发生发展，热休克反应等生物学问题。

      表观生物在国内率先推出微量meRIP-seq技术，通过技术优化，大幅降低meRIP的样本要求量，500ng-20ug 总RNA即可满足实验要求。利用最新的去rRNA技术，可以同时检测mRNA, lncRNA及环状RNA的甲基化修饰谱，帮助研究人员对RNA转录后甲基化修饰图谱进行全面研究，是表观转录组学研究的关键技术。同事，我们首推RNA代谢测序技术：SLAME-seq及翻译组测序技术Ribo-seq，助您深入解析m6A修饰位点及作用机制！

微量meRIP-seq送样要求 

样本类型：

1. 总RNA，500ng--20ug 

2. 细胞，数量为5x10⁶~10⁷ 

3. 组织，质量为10~20mg  

样本物种：
 仅限人、大小鼠物种，其他物种需评估 

表观生物实测数据

 

图1. Peaks结构百分比图

 

图2. m⁶A修饰位点富集于终止密码子区域

图3. motif分析结果

图4. 实测数据显示某特定基因的m⁶A修饰区域

分析内容：

一、数据质控
1.测序reads去接头，质量过滤
2.测序数据的质控
3.参考基因组和转录组的比对
4.Reads在基因组各原件的分布
5.富集peak的查找
6.Peak的统计，分布图绘制
7.motif分析
二.m6A修饰差异基因分析
1.差异m6A修饰mRNA注释分析
2.差异m6A修饰mRNA GO/KEGG分析
3.差异m6A 修饰 lncRNA注释分析（含miRNA前体）
三.高级分析
1.m6A修饰单位点注释分析
2.差异可变剪切与差异m6A修饰mRNA关联
3.差异翻译基因与差异m6A修饰mRNA关联

案例   Cell Stem Cell: m6A阅读器YTHDF2下调可抑制白血病  meRIP联合SLAM-seq、Ribo-seq，深入RNA修饰调控机制
     
本研究发现m6A阅读蛋白YTHDF2在AML患者身上广泛过表达，在小鼠和人类AML发生和发展过程中起着关键的作用。研究者敲除白血病前期细胞的YTHDF2，再进行meRIP-seq，发现敲除组中表达水平显著上调的mRNA具有丰富的m6A修饰。为了研究带有m6A修饰的mRNA的上调机制，研究者利用SLAM-seq检测mRNA的半衰期，证实m6A修饰使这些基因的半衰期延长了。

利用meRIP-seq分析Ythdf2敲除组和对照组的转录组m6A甲基化修饰图谱。B, Ythdf2敲除后mRNA表达减少、不变和增加的3个分组的m6A峰的错误发现率FDR。C, Violin图显示敲除组和对照组的表达变化，分了无m6A修饰、有m6A修饰和丰富m6A修饰的3个组做对比。D, 敲除组和对照组mRNA表达变化的累积分布曲线，敲除组有m6A修饰的mRNA表达上升。

利用SLAM-seq分析Ythdf2敲除组和对照组的转录组半衰期。E，衰减曲线显示敲降组的mRNA半衰期稍微增长。G，YTHDF2的缺失，使含m6A修饰mRNA半衰期进一步增长。

       随后，研究者利用RIBO-seq检测两个组的蛋白翻译效率，发现YTHDF2的缺失后，无论是有m6A修饰的还是没有m6A的mRNA，翻译效率都没有显著改变。这些结果表明YTHDF2在白血病中促进m6A mRNA的降解，而这个降解受m6A的指导。

利用RIBO-seq分析Ythdf2敲除组和对照组的翻译效率。H, 火山图显示两组的翻译效率变化。I,  两组mRNA，m6A高水平、m6A低水平和无m6A修饰的mRNA分别的累计分布曲线。

meRIP-seq联合SLAM-seq、Ribo-seq，进一步研究基因功能与机制！
即日起至11月30日，三项技术组合优惠价，只需8折！

原文：Paris J, Morgan M, Campos J, et al. Targeting the RNA m6A Reader YTHDF2 Selectively Compromises Cancer Stem Cells in AcuteMyeloid Leukemia. Cell Stem Cell. 2019 Jul 3;25(1):137-148.e6.
质量承诺：meRIP-seq motif分析结果须有显著的 RRACH（常见GGAC） 特征，如无可以申请全额退款或者免费重测！