非编码RNA研究
您现在的位置:首页 >> 产品与服务 >>  非编码RNA >>  非编码RNA研究
lncRNA/circRNA靶向miRNA 回收鉴定服务
发布时间:2018-04-18 12:37:31 | 浏览次数:

项目简介

      靶向miRNA回收鉴定服务,主要针对具有明确目标的lncRNA,circRNA, Pseudogene等非编码基因或mRNA分子,利用探针回收技术及基于miRNA qRT PCR芯片的方法检测目标RNA分子上所结合的miRNA,鉴定靶向miRNA。客户只需提供研究的mRNA/lncRNA/circRNA等分子序列和细胞模型即可。

 

技术优势

1、无需软件预测,甚至能检测到软件预测所遗漏的靶miRNA ;

2、直接检测到细胞中miRNA和RNA的真实结合情况;

3、能够检测到细胞中miRNA和RNA结合的改变情况。

 

项目流程


注意事项

1、研究须有合适的细胞株;

2、研究的RNA 在细胞株中有比较高的表达;

3、仅限人、大小鼠物种细胞;

4、miRNA qRT-PCR检测范围包含184个热门研究的miRNA。

 

研究案例

来自第二军医大学、浙江大学医学院和中国医学科学院的研究人员报告称,他们采用一种体内方法鉴别出了计算机算法无法预测到的目标miRNA,证实在肝癌中miR-92a作为一种致癌miRNA抑制了抑癌基因p21的表达。这一重要的研究发现发布在《癌症研究》(Cancer Research)杂志上。

                                                               图一、采用p21探针亲和纯化p21 mRNA

                                                               A、 亲和纯化过程的示意图。                      B、 p21 mRNA 上探针以及定量PCR 检测位点示意图。

                                                               C、 PCR 检测p21 探针对p21mRNA 的特异性回收效果。

                                                               D、 定量PCR 检测p21 探针的回收区域。 P: p21 探针; C: 对照探针。

                                                             图二、多条不能被预测到的miRNA 被鉴定靶向结合p21 mRNA
                                                         A、 多条miRNA 被鉴定靶向结合p21 mRNA。 B、 PCR 验证p21 探针对三个亲合力最高的miRNA 的特异回收效果。
                                                        C、 靶向回收鉴定到结合p21 mRNA 的miRNA 几乎都不能被五种常用的预测软件(TargetScan, PicTar,PITA,miRanda

                       和 RNA22)预测到。 P: p21 探针; C: 对照探针。

参考文章
Su X,et,al. An In Vivo Method to Identify microRNA Targets Not Predicted by Computation Algorithms: p21 Targeting by miR-92a in Cancer. Cancer Research. 2015; 75(14): 2875-85. (SCI IF=9.329)


 
 上一篇:
 下一篇:LongRNA-seq(circRNA+lncRNA+mRNA)

关注我们

联系我们

邮箱:service@epibiotek.com
电话:020-89855770   400-775-0875
地址:广州市经济技术开发区国际企业孵化器E406

关于我们

       表观生物专注于医学表观遗传与转录调控研究领域,提供尖端的新一代测序技术服务和试剂盒开发,推动以表观遗传组学为基础的精准诊断与精准治疗的转化医学应用,造福人类健康。

版权所有:广州表观生物科技有限公司 粤ICP备16111092号