外泌体longRNA测序服务
外泌体为大小30 ~100 nm 的细胞外泌性囊泡,具有脂质双层膜结构。近年研究显示,外泌体是细胞与细胞间通讯的重要的分子,参与诸多生理与病理过程。外泌体不仅包含蛋白质成分,还包括一些RNA成分,如微小 RNA( microRNA,miRNA) 、长链非编码RNA和mRNA、环状RNA(circular RNA,circRNA)。外泌体所携带的这些 RNA统称为外泌体来源 RNA,有望作为液体活检分子标志物,在精准医学发展上有着光明的前景。
表观生物采用Qiagen exoRNeasy Serum/Plasma Maxi Kit提取exosomal RNA,该试剂盒来源于美国Exosome Diagnostics, Inc.公司的技术,能够在20分钟内快速纯化得到细胞外囊泡,并获得更为全面的RNA分子,适合用于检测外泌体中的环状RNA及其他长片段的线性RNA。 我们结合最新的高通量测序技术和生物信息分析方案,将为您提供最为全面的外泌体longRNA测序服务!
此外,表观生物自主开发基于机器学习算法的外泌体RNA疾病诊断和预后模型构建工具,结合临床大样本,充分发挥外泌体RNA测序数据整体优势,构建精准的外泌体RNA诊断标志物模型,为开发创新型诊断试剂盒奠定坚实的基础。
测序与分析
外泌体RNA疾病诊断/预后评估模型构建流程
表观问答
机器学习算法实测数据示例
图1. 选择模型的候选marker
图2. 选择模型的最优超参数
图3. ROC分析training数据集
图4. ROC分析testing数据集