全基因组甲基化测序WGBS
项目简介
WGBS
WGBS即全基因组甲基化测序（Whole Genome Bisulfite Sequencing）是DNA甲基化研究的金标准，通过重亚硫酸盐Bisulfite处理，描绘全基因组单碱基分辨率的DNA甲基化图谱。
应用与优势
技术应用
1.绘制全基因组单碱基分辨率甲基化图谱
2.研究胚胎发育、衰老等生理活动发展的表观遗传机制
3.研究疾病相关甲基化分子标志物
技术优势
1.精准鉴定CpG富集位点 ，达到单碱基分辨率
2.覆盖全基因组，获得的甲基化信息更完整，是DNA甲基化研究的金标准
送样要求
样本类型：
细胞、全血、动物组织等，详询
1.≥ 3ug/样本，浓度≥ 30ng/ul
DNA
1~4ml/样本
血浆/血清
≥15ng
cfDNA
样本物种：仅限人、大小鼠，其他物种需评估
分析内容
1. 基因组比对统计 2. 整体甲基化水平评估 2.1平均甲基化水平 2.2甲基化分布图 3. 甲基化位点统计及样本间比较 3.1 甲基化水平相关性分析 3.2 甲基化水平主成分分析(PCA) 3.3 甲基化水平聚类分析 4. 差异甲基化分析 4.1 差异甲基化区域注释 4.2 差异甲基化区域长度分布 4.3 差异甲基化区域甲基化水平分布 4.4 差异甲基化区域甲基化水平聚类热图 4.5 差异甲基化区域可视化 4.6 差异甲基化区域相关基因GO、KEGG富集分析
DMR相关基因GO富集分析
DMR在锚定区域数量分布比例图
差异甲基化区域KEGG富集分析
差异甲基化区域甲基化水平聚类热图展示
差异甲基化区域平均甲基化水平分布
样本相关性分析