超级增强子鉴定服务
项目简介
超级增强子鉴定服务
超级增强子 (Super Enhancer, SE) 为8 ~ 20 kb具有转录增强活性的超长顺式作用元件,可富集高密度的关键转录因子(master transcription factors)、辅因子(cofactor)和增强子表观修饰标记(histone modification marks),并激活细胞中身份决定基因的表达,发挥调控细胞命运的关键作用,还能促进关键致癌基因表达,富集疾病相关变异,具有重大研究价值,已经成为生物医学领域的研究热点。
医学研究意义:1. 发现致病驱动基因。2. 分析疾病关联变异位点易感性。3. 开发基于SEs复杂性疾病的精准诊断和药物开发
鉴定流程
测序流程
送样要求
使用抗体:anti-H3K27ac/ anti-BRD4/ anti-P300
细胞/组织
样本类型
10*10^7
细胞数量
甲醛交联
样本处理
分析结果示例1
普通增强子与超级增强子差异(长度及数目)分析
分析结果示例2
普通增强子与超级增强子鉴定分析
分析结果示例3
超级增强子鉴定及数量分析图绘制
分析结果示例4
超级增强子结合转录因子预测
分析结果示例5
普通增强子与超级增强子信号富集图绘制
分析结果示例6
超级增强子的注释及调控靶基因预测
分析结果示例7
超级增强子调控靶基因KEGG、GO分析
超级增强子整体课题研究策略